Il contratto con il Comune di Genova per la mappatura culturale della città vecchia - II fase impegnava l'università a non apportare modifiche senza motivazione alla cartografia già consegnata nella fase precedente e utilizzata per la redazione della variante generale al Prg. Alcune modifiche si sono tuttavia rese necessarie per diversi ordini di motivi, che vengono di seguito riportati.
Oltre alle modifiche di tipo tecnico come la trasformazione dei cavedi "disegnati" in poligoni veri e propri, con la bucatura dei poligoni rappresentanti gli edifici, l'osservazione dell'edificato ad opera dei gruppi di rilevatori ha portato ad evidenziare i seguenti ordini di differenze tra le due basi cartografiche:


Questi poligoni si ritrovano anche sul livello dei corpi-bassi mentre non vengono rappresentati nel livello dei civici in quanto questo rappresenta una sezione al terzo piano.
Altri esempi di queste modifiche sono i corpi: [1]
0052013_0 corpo del civ 13 VIA DI SANT'AGNESE 0342010_3 corpo 3, civ. 10 VIA BALBI 0342029_1 corpo 1, civ. 29 VIA BALBI 0342029_2 corpo 2, civ. 29 VIA BALBI 0436002_1 corpo 1, civ. 2 SAL S. BARTOLOMEO CARMINE 0436006_0 corpo del civ. 6 SAL. S BARTOLOMEO CARMINE 0436011_0 corpo del civ. 11 SAL. S BARTOLOMEO CARMINE 0496002_3 corpo 3, civ. 2 VIA DINO BELLUCCI 0496004_11 corpo 11, civ. 4 VIA DINO BELLUCCI 0496013_0 corpo del civ. 13 VIA DINO BELLUCCI 0496015_0 corpo del civ. 13 VIA DINO BELLUCCI 0814006_2 corpo 2, civ. 6 SALITA DI SANTA BRIGIDA 1228018_0 corpo del civ. 18 SALITA DI CARBONARA 1228040R_0 corpo del civ. rosso 40 SALITA DI CARBONARA 1764001_2 corpo 2, civ. 1 VICO DELLA CITTADELLA 3048004_2 corpo 2, civ. 4 SALITA ANTONIO GIUSTI 39540PC_0 parcheggio coperto VICO DELLE MONACHETTE 3956004_0 corpo del civ. 4 SALITA MONACHE TURCHINE 4240011_1 corpo 1, civ. 11 DISCESA A SAN NICOLOSIO 4240015_0 corpo del civ. 15 DISCESA A SAN NICOLOSIO 4240039_1 corpo 1, civ. 39 DISCESA A SAN NICOLOSIO 5454004_0 corpo del civ. 4 SALITA SUP RONDINELLA 6056007_0 corpo del civ. 7 VIA CARLO TARGA 6056015_0 corpo del civ. 15 VIA CARLO TARGA 6264010N_11 corpo 1, nuovo civ 10 PIAZZA TRUOGOLI S BRIGIDA 6264010N_4 corpo 4, nuovo civ 10 PIAZZA TRUOGOLI S BRIGIDA 6264018_1 corpo 1, civ 18 PIAZZA TRUOGOLI S BRIGIDA.
In alcuni casi vengono inoltre apportate modifiche alla forma del corpo per rappresentare atri, passi carrabili, archivolti, come nei casi dei corpi:
6312003_0 corpo del civ 3 VIA DI VALLECHIARA 4242012_0 corpo del civ 12 SALITA DI SAN NICOLOSIO 0342036_0 corpo del civ 36 VIA BALBI
0342040_1 corpo 1, civ 40 VIA BALBI 3954008_3 corpo 3, civ 8 VICO DELLE MONACHETTE.
Nella carta allegata i casi elencati vengano rappresentati secondo le seguenti convenzioni grafiche: in puntinato rosso viene rappresentato il livello dei corpi così come risulta dai sopralluoghi, in giallo la precedente cartografia, il giallo pieno e il puntinato rosso su campo bianco individuano le differenze tra le due cartografie.
La cartografia riporta la tematizzazione di alcuni poligoni corrispondenti a corpi edificati inseriti in edifici specialistici (chiese, musei, etc.). La tematizzazione deve tuttavia essere riferita ai soli segmenti abitativi degli edifici in oggetto.